Переписал на диск с файловой системой exfat большой каталог со множеством файлов на ОС Windows 7. При попытке работы с этим каталогом из под Ubuntu диск постоянно отваливался с ошибкой:

Функция stat завершилась с ошибкой: Конечная точка передачи не подсоединена" ("Transport endpoint is not connected").

После проверки внешнего диска командой:

sudo fsck.exfat /dev/sdc1

возникали ошибки:

ERROR: name is too long. и BUG: failed to convert name to UTF-8.

После гугления решил вручную обновить драйвер exfat - https://github.com/relan/exfat. Проблема ушла, но теперь пропало автоматическое монтирование диска. Монтировать можно только в ручном режиме.

Для решения проблемы автоматического монтирования, нужно установить скомпилированные бинарные программы в правильное место.

Для этого делаем:

# удаляем скомпилированные программы из /usr/local/sbin
sudo make uninstall
# меняем директорию для установки (после --prefix пусто(!))
./configure --prefix=
# устанавливаем в /sbin
sudo make install

Для решения проблемы файлов с длинным именем в пути, я нашел их, просмотрел что там нет ничего важного, и удалил командой:

find -regextype posix-extended -regex '.{257,}' -delete

Что бы просто просмотреть файлы с длинными путями, нужно выполнить команду без параметра -delete.