После настройки openvpn клиента, блокировки Роскомнадзора все равно срабатывали. Выяснилось что менеджер сетевых соединений Network Manager в Ubuntu использует свой встроенный dns.

Из-за этого не работали dns сервера, которые я прописывал. Для отключение этой функции, воспользуемся советом со Stackoverflow:

sudo vim /etc/NetworkManager/NetworkManager.conf

В файле закоментировать строку:

#dns=dnsmasq

Сделать перезапуск Network Manager:

sudo systemctl restart NetworkManager